El día 4 de marzo de 1963 se colocó la primera piedra de nuestro templo, que fue traída desde el Castillo de Javier por D. Fermín Alonso, presidente del Hogar Navarro en esa época.
La ceremonia fue oficiada por el Obispo de Bilbao, D. Pablo Gúrpide y por el párroco D. Manuel Rámila. Asistieron autoridades de la época (gobernador militar, vicepresidente de la Diputación, representantes del Ayuntamiento, del Gobierno Civil, y de la Jefatura Superior de Policía).
El arquitecto autor del proyecto fue D.Pedro Ispizua Uríbarri, también presente en la ceremonia.
Bajo la primera piedra, se depositó un cartucho con un ejemplar de la prensa del día (La Hoja del Lunes), un lote de monedas de la época, dos medallas (una de S. Francisco Javier y otra de la Virgen de Begoña), un folleto denominado “Xavier” del mes de febrero de 1963, un díptico del Seminario Diocesano y un pequeño pergamino firmado por D. Pablo Gúrpide y diez personas más (D. Pedro Ispizua y D. Manuel Rámila entre otros)
El 18 de marzo de 1965 se inauguró el nuevo templo. La noticia se publicó en La Gaceta del Norte, con una pequeña descripción.
La obra costó once millones de pesetas, de las cuales, en la fecha de inauguración se habían pagado 6 millones.
